1. 杉本真樹 ：消化管・肝胆膵ベッドサイドイメージング　Mac対応フリーソフトウェアOsiriXでつくる3Dナビゲーション(DVD付) へるす出版 東京、2009.
  2. 杉本真樹,松岡雄一郎, 田中紘一、Francesco Volonte, Philippe Morel, 東　健. OsiriX Stereo 3D可視化技術と光学的電力学的センシングを統合したリアルタイムロボット手術ナビゲーションシステムの開発. 日本コンピュータ外科学会誌12(3) 192-193, 2010.
  3. 杉本真樹.“医領”解放構想による医療イノベーション　スマートデバイスがもたらす医療3.0 新医療436(4)137-140, 2011.
  4. 杉本真樹.iPadやiPhoneなどのツールで医療者・患者さんの情報共有を進め「医領解放」を実現して医療が抱える課題を解決するINNERVISION 26(2)26-27,2011
  5. 杉本真樹.医療3.0–携帯情報通信端末iPhone/iPadがもたらす次世代医療 (特集 医療を変えるiPhone/iPad) 看護学雑誌 74(12) 18-23, 2010
  6. 杉本真樹, 田中紘一, 東健,　他. ロボット手術と最新の内視鏡外科手術 ロボット手術, NOTESにおける実時間的手術ナビゲーションSurgery Frontier17(3)234-243,2010
  7. 杉本真樹. 医療現場に変革をもたらす「オザイリクス」 臨床における使いやすさこそ、最大の魅力 (特集 医療・介護分野のiPhone/iPad活用事例)Visionと戦略 7(11) 10-13 2010年11月
  8. 杉本真樹,久津見弘, 東 健,他. NOTESのための画像診断と手術ナビゲーション. 消化器内視鏡22(10)1691-1697,2010.
  9. 杉本真樹,久津見弘, 東 健,他. OsiriXによる胆道疾患の画像診断と二酸化炭素MDCT胆道造影. 臨牀消化器内科25(12)1591-1596,2010.
  10. 杉本真樹.外科医主導型手術ナビゲーションOsiriXの開発: 次世代低侵襲手術NOTES, SPS,ロボット手術の展望.Medical Torch 6(1)28-31, 2010
  11. 杉本真樹. 消化管・肝胆膵ベッドサイドイメージング1:フリーソフトウェアOsiriXでつくる3Dナビゲーション. 消化器外科 32(6) 1085-1092,2009.
  12. 杉本真樹. 消化管・肝胆膵ベッドサイドイメージング2: フリーソフトウェアOsiriXによる画像解析ベーシックガイド 消化器外科 32(7) ,1239-1251 2009.
  13. 杉本真樹,久津見弘,東健,　他. 消化管・肝胆膵ベッドサイドイメージング3: フリーソフトウェアOsiriXによるPACS　e-ラーニング 消化器外科 32(8), 1371-1379, 2009.
  14. 杉本真樹,久津見弘,東健, 他. 消化管・肝胆膵ベッドサイドイメージング4: フリーソフトウェアOsiriXによる遠隔医療とテレメンタリング 消化器外科 32(9)1499～1505, 2009.
  15. 杉本真樹. OsiriX for mobile teleradiology. RadFan 8(1)58-60,2010.
  16. 杉本真樹. 放射線科医療情報システムのトレンドを探る.OsiriXよるベッドサイドイメージング. RadFan 7(7),39-44 2009.
  17. 杉本真樹, 山本修司. OsiriX 3.0によるCADシステム構築の新たな展開 Rad Fan 6(3)5-10,2008.
  18. 杉本真樹. OsiriX in RSNA 2007; Apple Hands-on Computer Workshop and The 3rd OsiriX User Meeting. Rad Fan 6(2) 79-84, 2008.
  19. 杉本真樹, 安田秀喜, 幸田圭史, 他. 先端医療と内視鏡外科手術: OsiriXによる内視鏡外科手術・NOTESナビゲーションの有用性: Wireless motion sensing追従ナビゲーションとimage overlay surgery.日本内視鏡外科学会雑誌 13(6) 693-702, 2008.
  20. 杉本真樹, 安田秀喜, 幸田圭史, 他. 術前画像診断とNavigation Surgery:胆道疾患;　 CO₂ MDCT仮想膵胆道造影およびImage overlay surgeryとNOTES navigation.日本外科学会雑誌109(2)77-83,2008
  21. 杉本真樹.外科医主導型手術ナビゲーションOsiriXの開発: 次世代低侵襲手術NOTES, SPS,ロボット手術の展望.Medical Torch 6(1)28-31, 2010
  22. 杉本真樹. NOTES（経管腔的内視鏡手術）-体表面に創を作らない新しい低侵襲手術:新たな3D画像支援システム：経管腔的内視鏡ナビゲーションによるNOTES・Single Port Surgery. 医学のあゆみ230(13) 8537-8542, 2009.
  23. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(1)基礎編
 消化器外科30:225-231, 2007.
  24. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(2)応用編
 消化器外科30:341-350, 2007.
  25. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(3) 外科的処置における実践応用
消化器外科30:479-486, 2007.
  26. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(4)画像支援手術と双方向通信による術中迅速病理診断システム 消化器外科30:637-644, 2007.
  27. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(5) Augmented Reality(拡張現実)による手術支援システム 消化器外科30:1129-1137, 2007.
  28. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(6) 3D fusion PET-CTによる消化器癌進展,転移の立体診断 消化器外科30, 1235-1244, 2007.
  29. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(7) 二酸化炭素送気MDCTによるfusion arterio-colonographyとvirtual colonoscopyの結腸直腸癌診断 消化器外科30,389-1398, 2007.
  30. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(8)二酸化炭素MDCTによるFusion virtual arterio-gastrographyとvirtual gastroscopyの胃癌診断と胃切除手術ナビゲーション 消化器外科30, 1517-1526, 2007.
  31. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他. OsiriXによるCAD（コンピュータ支援診断）システム構築(9) 急性腹症関連結腸良性疾患の3D virtual imaging:巨大結腸症,結腸軸捻転症, 腸間膜動静脈閉塞症 消化器外科30, 1647-1656, 2007.
  32. 杉本真樹，安田秀喜, 幸田圭史, 他.癌の術式選択のための画像ナビゲーション2.胃癌の手術ナビゲーション 消化器外科31, 1647-1656, 2007.
  33. Sugimoto M. Recent advances in visualization, imaging, and navigation in hepatobiliary and pancreatic sciences.J Hepatobiliary Pancreat Sci. 2010 Sep;17(5):574-6. Epub 2009 Oct 6.
  34. Sugimoto M, Yasuda H, Koda K, et al. Image overlay navigation by markerless surface registration in gastrointestinal, hepatobiliary and pancreatic surgery. J Hepatobiliary Pancreat Sci. 2010 Sep;17(5):629-36. Epub 2009 Oct 2.
  35. Sugimoto M, Yasuda H, Koda K, et al. Carbon dioxide-enhanced virtual MDCT cholangiopancreatography. J Hepatobiliary Pancreat Sci. 2010 Sep;17(5):601-10. Epub 2009 Oct 6.
  36. Sugimoto M, Yasuda H, Koda K, et al. Virtual CO2 MDCT pancreatography: A new feasible technique for minimal invasive pancreatectomy in intraductal papillary mucinous neolpasms. Hepatogastroenterology 55 (81) 270-274, 2008.
  37. Sugimoto M, Takada T, Yasuda H, et al. MPR-hCT imaging of the pancreatic fluid pathway to Grey-Turner’s and Cullen’s sign in acute pancreatitis. Hepatogastroenterology 52(65) 1613-1616. 2005.
  38. Volonté F, Pugin F, Bucher P, Sugimoto M, Osman Ratib, Morel P. Augmented reality and image overlay navigation with OsiriX in laparoscopic and robotic surgery – not only a matter of fashion. J Hepatobiliary Pancreat Sci.18(3), 2011 [in press]
  39. 菅野忠博, 杉本真樹.  OsiriXをもっと知ろう:OsiriXってなに?映像情報Medical 43(1)70-75,2011.
  40. 菅野忠博, 杉本真樹. OsiriXをもっと知ろう:OsiriXはこうして誕生した. 映像情報Medical 43(2)154-157,2011.
  41. 菅野忠博, 杉本真樹.  OsiriXをもっと知ろう:OsiriXは何ができるか.映像情報Medical 43(3)244-248,2011.